Jde o unikátní diagnostickou metodu vyvinutou vědci ze společnosti BioVendor v Brně. Vycházejí z tzv. In silico studií, tedy simulací vedených počítačem. BioVendor má licencovanou metodu měření microRNA, kterou vyvinuli a patentovali partneři ve Švédsku.
“Diagnostika Covid-19 pomocí microRNA, tedy molekul menších než DNA, je u nás jedinečná, zatím s ní nikdo nepracuje. Díky tomu, že máme k dispozici unikátní patentovanou metodu měření miRNA, na které běžné diagnostické metody nefungují, byli jsme schopni vyzkoušet tuto metodu i na diagnostice Covid-19 poměrně rychle,” dodává Grešáková.
S microRNA se v diagnostice už pracuje, pomáhají diagnostikovat třeba rakovinu
V BioVendoru se inovativními metodami založenými na microRNA zabývají poslední čtyři roky a ukazují, že jsou využitelné v oblastech diagnostiky mnoha patologií a identifikaci jejich stádií. Díky sledování chování těchto molekul už umí rozpoznat například nádor tlustého střeva z krve pacienta nebo další druhy rakovin. Teď se zaměřili také na diagnostiku Covid-19, která by mohla pomoci snížit množství vážných průběhů nemoci.
Nová metoda nepracuje jen s molekulami viru, ale i těmi lidskými
Nové diagnostické soupravy pro diagnostiku Covid-19 budou pracovat s lidskými microRNA, podle jejichž specifické hladiny by výsledky mohly upozornit na to, že u konkrétního člověk je zvýšené riziko napadení určitých orgánů virem. Díky tomuto testu tak bude možné predikovat, zda je daný konkrétní člověk v rizikové skupině a které jeho orgány jsou ve vyšším riziku. Vědci zatím pracují s více než patnácti typy lidských microRNA molekul, každá z nich ukazuje na jiné riziko. Lékaři by tak měli o každém pacientovi mnohem podrobnější informace než dosud.
V BioVendoru zároveň ale pracují na detekčním systému pro měření virových microRNA, typických pro virus SARS-CoV-2. Přítomnost virových miRNA je indikátorem aktivity koronaviru. “Znamená to, že souprava, kterou vyvíjíme, dokáže rozpoznat jak lidské buňky, tak i virové částice na molekulární úrovni a díky tomu budeme schopni předpovědět, co virus v těle konkrétního pacienta udělá a jak zareaguje jeho imunitní systém. Zda si pacient projde virovou nákazou asymptomaticky nebo u něj hrozí vyšší riziko vážnějších komplikací,” vysvětluje Grešáková z R&D týmu BioVendoru.
Pacienti, kterým hrozí vážný stav, by mohli podstoupit preventivní terapii včas
Lékaři by poté mohli léčbu přizpůsobit konkrétním pacientům mnohem dříve, než je tomu nyní. Teď se mnozí z nakažených do nemocnic totiž dostávají až ve vážném stavu. Přesnější testování by mohlo pomoci personalizovat léčbu a podchytit vážné reakce konkrétního pacienta včas. “Na druhou stranu by pak teoreticky nemuselo být nutné izolovat pacienty, jejichž imunitní systém reguluje microRNA viru v těle pacienta dostatečně. U takového člověka by zabrala základní terapie a podpora imunitního systému, který virus zvládne sám,” upozorňuje Grešáková.
“Do teď se testování zaměřuje pouze na přítomnost viru v těle pacienta, případně na to, zda si pacient po prodělání nemoci vytvořil protilátky. Nová metoda by přinesla mnohem více informací o konkrétních projevech nákazy a mohla by pomoci zaměřit lékařskou péči přesněji a především preventivně na pacienty, kteří jsou ve vyšším riziku,” popisuje ředitelka molekulární divize v BioVendor Group Eva Pindurová.
Novou diagnostickou metodu by laboratoře mohly vyzkoušet už na jaře
Metoda diagnostiky pomocí microRNA je už ověřena v jiných oblastech, největší význam jí vědci přisuzují v oblasti diagnostiky různých typů rakovin. Co se Covid-19 týče, je souprava pro diagnostiku BioVendoru ve fázi testování, do laboratoří by se ale mohla nová metoda dostat v rámci klinické validace už v průběhu května.
BioVendor nyní pracuje i na dalších metodách testování Covid-19
“V současnosti pracujeme na několika různých způsobech testování. Díky kombinaci přístupů jsme tak schopni přinášet o konkrétních pacientech komplexní informace. Důležitá je samozřejmě informace, zda pacient je nebo není nakažen virem. To se dnes zjišťuje například PCR testy. Pomocí masivního paralelního sekvenovaní, tzv. metody NGS, lze pak určit také přesnou sekvenci viru, jeho původ a odhalit možné mutace v jeho genomu. Za pomoci sofistikovaného softwaru, který na míru pro BioVendor naprogramovala společnost Bioxsys, lze získaná data i správně vyhodnotit. Díky diagnostickým metodám založeným právě na detekci microRNA jsme pak schopni predikovat, jak bude imunitní systém pacienta s velkou pravděpodobností na nákazu reagovat,” shrnuje Pindurová.
BioVendor Group kromě jiného pracuje na vývoji následujících způsobů molekulární diagnostiky SARS-CoV-2 a přináší tím unikátní komplexní přístup k diagnostice nového koronaviru:
- Diagnostika pomocí microRNA - díky unikátní metodě, která dokáže měřit microRNA je možné predikovat reakci pacienta na nákazu a predikovat také to, které jeho orgány jsou v ohrožení
- Metoda NGS pro tzv. sekvenování - umožňuje čtení genomu viru. Díky sofistikovanému softwaru je možné analyzovat, odkud pochází virus, kterým je konkrétní pacient nakažen a také odhalit případné mutace viru
- LAMP testy - nová technologie, která pracuje s odběry ze slin a podobně jako PCR testy detekuje přítomnost viru v těle pacienta, její výhodou je jednoduchost použití, menší náročnost na přístrojové vybavení a rychlost
